Bakterileri toksinleri nedeni ile infeksiyon hastalıklarında midede, hiperkinezi, hipokinezi meydana gelebilir. Hemen her infeksiyon hastalığının başlangıcında bir gastritis hali gelişebilir. Bu nedenle bulantı, kusma görülebilir.

Gerek mikroorganizmanın barsak duvarını tnfiltre etmesi, gerekse yine toksinlerin barsak peristaltizmini arttırması ve su elektrolit sekresyon ve reabsorbsiyon mekanizmalarını etkilemesi nedeni ile pek çok enfeksiyon hastalığı seyri sırasında ishal meydana gelir. Gaita infeksiyon etkeninin belirlenmesinde yol gösterici olacak şekilde değişik görüntü ve miktarlarda olabilir. Örneğin shigella infeksiyonlarında kanlı mukuslu gaita olurken, kolerada pirinç suyu gibi ishal olmaktadır.