Tanı konurken üretrit yapan diğer nedenler, sifiliz, dissemine gonore infeksiyonu, Reiter sendromundan ayırıcı tanı yapılmalıdır.

Üretrit etkeni kesin belli olduktan sonra, ilgili ajana göre uygun antimikrobiyal tedavi verilmelidir.

Nongonokokal üretrit tedavisi için önerilen şemalar şöyledir:

Tetrasiklin HCI günde 4 kez 500 mg PO, 7 gün veya doksisiklin günde 2 tez 100 mg PO, 7 gün. Tetrasiklin kontrindike olan ya da tolere edemeyen hastalarda Eritromisin günde 4 kez 500 mg PO, 7 gün süreyle verilmelidir. Quinolone grubu antibiyotikler de tedavide denenmiş, ancak tetrasiklinden daha etkili bulunmamışlardır. Tetrasiklin kontrindike olan durumlarda alternatif ilaç olarak kullanılabilir.

Tedaviye alınan hastaların cinsel partnerleri de yukarıdaki rejimlerden biri ile tedavi edilmelidir.