Çocuklarda kapak replasmanının uzun vadedeki etkileri erişkinlerdekinden farklılık arzeder. Bunlar arasında prostetik kapağın boyutu, ki çocuk büyüdükçe kan akımında bir kısıtlanma olabilecektir; prostetik dayanıklılık; tromboembolik olaylar; ve uzun süreli antikoagülasyona bağlı sekonder komplikasyonlar sayılabilir. Çocuklarda hem mekanik ve hem de biyoprostetik kapaklar başarıyla kullanılmıştır, ve seçilmiş serilerde warfarin ve aspirin antikoagülasyon protokolleriyle iyi sonuçlar elde edilmiştir.