alınmadan önce bulundukları uygun ortamda toksinlerini üretirler. Enterotoksijenik E.coli ısıya dayanıksız (LT) ve ısıya dayanıklı (ST) olarak iki tip toksin salgılar. Isrya dayanıksız (LT) toksin barsak epitelinde intrasellüler cAMP miktarını artırırken, ısıya dayanıklı (ST) toksin hücrede GMP düzeyini artırarak guanil siklaz sistemi üzerine etki gösterir. Bazı mikroorganizmalar sitotok-sin olarak adlandırılan ve doğrudan barsak mukozasına zarar veren bir toksin salgılarlar. Shigella dysenteriae’nin toksini hem sitotoksik hem de enterotoksik özelliktedir. E.coli, salmonella ve bazı vibrio türleri de sitotoksin salgılarlar.