Bu dönemde, baş ağrısı, titreme, ateş ve eklem ağrısı gibi sistemik belirtiler de olabilir. Penis gövdesi boyunca bulunan küçük lenf bezlerinde de aynı gelişme vardır. Lenf bezleri yerlerinde skatriks bırakarak iyileşmesi sırasında oluşan skatriks lenfatik obstrüksiyon yapıp, genital ödem, distorsiyona (saksafon penis) neden olabilir. Yine bu iyileşme sırasında üretral striktür ve fistüller meydana gelebilir.

Kadın hastalarda İnguinal lenf bezlerinin tutulumu daha nadirdir. Tutulum sıklıkla perirektal bezlerde meydana gelir. Bu da intestinal LGVa neden olur. Intestinal LGV genellikle sinsi seyreden bir proktitis şeklinde kendini gösterir. Tenesmus, kanlı mükopürulan bir akıntı vardır, rektoskopide yüzeysel ülserasyon ve ince polipoid granülasyon görülür. Hastalık sigmoid ve inen kolona doğru yayılabilir. İleri vakalarda fibroslz ve darlıklar, rektovaginal flstüller gelişebilir. Aynı klinik tablo homoseksüel erkeklerde de görülebilir.

Her iki cinste de hastalığın bu lokal belirtilerle seyri sırasında baş ağrısı, titreme, ateş, eklem ağrısı, bulantı, kusma gibi sistemik semptom ve generalize rash, splenomegali, generalize lenfadenopati ve meningismus gibi klinik bulgular da gelişebilir.