Gİ, yumuşak sankr, sifiliz, LGV ve bazı malign hastalıklarla karışabilir. Yumuşak şankr ülser kenarları GI ülserlerinden değişik olarak belirsiz ve irregülerdir. Sifilizden ayırmak için mutlak sifiliz serolojik testleri yapılmalıdır. Malignansiler biyopsi ile ayrılabilir.