• DNA replikasyonu sırasında oluşan hatalar nedeniyle
• Kimyasal mutasyonlara maruziyet sonucu, ör: baz analogları (bazları taklit ederler fakat uygunsuz bir şekilde eşleşirler); alkilleyici ajanlar (bazlara alkil grubu eklenmesi eşleşmeyi (pairing engeller); ortaya eklenen ajanlar (intercalating agents) (DNA arasına eklenerek yapısını bozarlar); diğer doğrudan DNA üzerine etkili ajanlar.
• UV/iyonize edici radyasyona maruziyete bağlı
• Metillenmiş sitozinlerin deaminasyonu nedeniyle