Kistler, vücudun derinliklerinde de oluşabilirler. Tüm kistlerin balon gibi yuvarlak bir yapıları olmasına rağmen, vücut içinde oluşan kistler daha büyük olabi­lirler ve bazen kanseröz (kanser­leşmiş) bir tümörün ya da ciddi başka bir rahatsızlığın bir parçasıdırlar.