Tek bir ilaç yerine iki veya daha fazla antimikrobiyal ilacın aynı anda kullanılma nedenleri şu şekilde sıralanabilir.
(1) Ciddi infeksiyonu bulunan çok ağır hastalarda etkin bir tedavinin başlatılmak
(2) Birbirleri ile çapraz reaksiyon vermeyen ikinci ve hatta üçüncü bir ilacı kullanarak, kronik infeksiyonlarda tek bir ilaca karşı gelişebilecek dirençli susların ortaya çıkmasının önlenmek istenmesi. Buna en çarpıcı örnek olarak, geniş mikrobiyal popülasyonla birlikte olan, herhangi bir organın aktif tüberkülozu verilebilir.
(3) Özellikle travmayı takiben gelişen
(4) Bakterisidal sinerjizim’in (Bactericidal synergism) sağlanmak istenmesi. Bazı infeksiyonlarda, örneğin enterokok sepsisinde, infeksiyonu kombinasyon tedavisi ile tek ilaç tedavisine oranla daha etkin bir şekilde ortadan kaldırmak mümkün olur. Ancak böyle bir sinerjizmi önceden tahmin etmek her zaman mümkün olmaz ve birlikte katlanılan 2 ilaç bazen tek bir bakteri susu için sinerjetik olabilir.