Fagositozda etkin bir rol oynayan opsoninler çok defa spesifik antikorlar olmakla birlikte, kompleman 3b veya fibronectin gibi antikor olmayan maddelerden de yapılmış olabilir. Fagositoz esnasında lizo-zomlar (Lysosomes) fagozomlarla (Phagosomes) birleşirken fagositlerin içine alınan bakteriyi de plazma membranı çevirir. Fagozomlar içine salgılanan litik enzimler neticede bakterinin ölümüne yol açar. Bu işlemlerden herhangi biri aksarsa immünite ciddi bir şekilde bozulmuş demektir. En ciddi immünite bozuklukları kemotaksis ve hücre içi öldürme safhalarında ortaya çıkmaktadır.